树莓种质资源描述规范和数据标准

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张冰冰宋洪伟作 著
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店铺: 广影图书专营店
出版社: 中国农业科学技术出版社
ISBN:9787511612021
商品编码:29710024596
包装:平装
出版时间:2013-10-01

具体描述

基本信息

书名:树莓种质资源描述规范和数据标准

定价:29.00元

售价:19.7元,便宜9.3元,折扣67

作者:张冰冰宋洪伟作

出版社:中国农业科学技术出版社

出版日期:2013-10-01

ISBN:9787511612021

字数:

页码:

版次:1

装帧:平装

开本:12k

商品重量:0.4kg

编辑推荐


内容提要


树莓种质资源描述规范规定了树莓种质资源的描述符及其分级标准,以便对树莓种质资源进行标准化整理和数字化表达。树莓种质资源数据标准规定了树莓种质资源各描述符的字段名称、类型、长度、小数位、代码等,以便建立统一、规范的树莓种质资源数据库。树莓种质资源数据质量控制规范规定了树莓种质资源数据在采集全过程中的质量控制内容和质量控制方法,以保证数据的系统性、可比性和可靠性。

目录


作者介绍


文摘


序言



现代农业植物基因组学研究前沿:技术、方法与应用 书籍简介 本书是一部全面深入探讨现代农业植物基因组学研究前沿领域的专业著作。它系统梳理了近年来在植物基因组测序、结构分析、功能解析以及基因组学数据管理与应用方面取得的重大进展,旨在为农业科研工作者、育种专家以及相关领域的研究生提供一本前沿、实用且具有深度参考价值的工具书和学习指南。全书内容紧密结合当前农业生产对高产、抗逆、优质作物品种的迫切需求,聚焦于如何通过基因组学手段加速现代育种进程。 第一部分:植物基因组测序技术革新与实践 本书首先从基因组测序技术的飞跃式发展切入,详细剖析了新一代测序(NGS)技术,特别是长读长测序技术(如PacBio SMRT和Oxford Nanopore Technologies)在植物基因组研究中的应用优势。 1. 高质量基因组组装的挑战与策略: 深入讨论了如何利用不同长度的读长数据(Short-read, Long-read, Ultra-long-read)进行多层次的基因组组装,以解决大型、重复序列丰富的植物基因组(如小麦、玉米)的组装难题。重点介绍了从De novo组装到参考基因组构建的完整流程,包括从数据预处理、错误校正、Scaffolding到Gap-filling的精细操作。 2. 变异检测与精细定位: 详细阐述了基于重测序数据的单核苷酸多态性(SNP)、插入缺失(InDel)以及结构变异(SV)的高效检测方法。特别关注了利用基因组变异图谱来识别驱动作物性状改良的关键基因位点(QTLs/eGenes)的生物信息学流程和统计学模型的应用。 3. 表观遗传组学与单细胞组学集成: 探讨了DNA甲基化、组蛋白修饰等表观遗传标记与基因表达的动态关系研究,以及单细胞测序技术如何揭示植物组织和发育阶段中细胞异质性对基因表达的影响,为理解复杂性状的调控网络提供了新的视角。 第二部分:基因组结构与功能解析的深入挖掘 本部分着重于如何从海量基因组数据中提取有意义的生物学信息,并将其转化为可操作的育种材料。 1. 基因组注释与功能预测: 系统介绍了结构基因(编码基因)和非编码元件(如启动子、增强子、转座子等)的自动化和手动注释流程。重点讲解了基于同源性比较、机器学习模型预测以及组织特异性表达分析,对新发现基因的功能进行初步的生物学假说构建。 2. 比较基因组学与进化分析: 阐述了如何通过比较不同物种或同一物种不同品种间的基因组结构、基因家族扩张与收缩,来推断作物的驯化路径和重要性状的进化驱动力。详细介绍了共线性分析、基因组砌块重排(Genome Rearrangement)的识别方法。 3. 转录组和蛋白质组学的多组学整合: 强调了基因组学数据必须与动态的转录组(RNA-seq)、蛋白质组等数据相结合,才能完整描绘生物学过程。详细介绍了如何使用差异表达基因分析、基因共表达网络构建(WGCNA)来识别核心调控通路。 第三部分:大数据管理、计算生物学工具与应用 基因组学研究产生了TB级的数据,有效管理和分析这些数据是成功的关键。 1. 基因组数据库构建与共享标准: 探讨了构建高效、可检索的植物基因组信息学平台的最佳实践,包括元数据(Metadata)的标准化记录、数据质量控制流程以及数据互操作性标准(如MIAME/MIAPE的遵循)。强调了数据公开与共享在加速全球作物育种研究中的重要作用。 2. 计算资源优化与算法应用: 针对大规模基因组数据分析中常见的计算瓶颈,本书提供了云计算平台、高性能计算(HPC)集群的资源配置建议,并重点介绍了用于基因组组装、变异比对的最新并行计算算法和软件工具包的使用教程。 3. 基因组辅助育种的策略与展望: 将基因组学研究成果直接转化为农业实践。详细介绍了如何利用分子标记辅助选择(MAS)、基因组选择(GS)以及靶向诱变技术(如CRISPR/Cas9)在快速创建优良新品种中的应用案例,包括抗旱性、抗病性以及营养品质的改良。 结语 本书不仅是技术手册,更是对未来农业生物技术发展方向的深刻洞察。通过对基因组学前沿技术的系统梳理和实际应用案例的深入剖析,本书旨在启发读者跳出传统育种的思维定式,利用强大的基因组信息学工具,推动作物遗传改良进入精准、高效的新时代。全书论述严谨,图表丰富,是高层次植物科学研究人员不可或缺的参考资料。

用户评价

评分

我是一名对生物多样性保护和信息科学交叉领域颇感兴趣的学生,看到《树莓种质资源描述规范和数据标准》这本书名,我立刻被吸引了。在我看来,种质资源是国家和民族的宝贵财富,而树莓作为一种重要的经济作物,其遗传多样性的保护显得尤为关键。然而,如果没有一套统一的描述和数据标准,我们就很难全面、准确地了解和评估现有的种质资源,更谈不上有效的保护和合理的应用。这本书的出现,仿佛为我们建立了一个通用的“图谱”,能够帮助我们系统地梳理和记录下每一份珍贵的树莓基因。我非常期待书中能够深入探讨如何从形态学、生理生化、分子生物学等多个维度来描述种质资源,并提出一套科学、可操作的数据采集、存储和共享方案。尤其希望书中能涉及到一些关于如何利用信息技术来构建种质资源数据库、开发数据管理系统,以及如何通过标准化的数据来支持种质资源的鉴定、评价和利用等方面的论述,这对于未来的种质资源研究和保护工作具有深远的意义。

评分

一本关于树莓种质资源描述规范和数据标准方面的书籍,光是书名就足以让我这个对植物分类、育种以及信息管理都有着浓厚兴趣的读者感到跃跃欲试。我一直深信,科学研究的基石在于严谨的数据和统一的标准。尤其是在农业领域,无论是新品种的选育、遗传多样性的保护,还是跨区域的合作研究,一套清晰、详尽且具有普适性的规范都是不可或缺的。想象一下,当不同研究机构、不同国家的研究人员在交流树莓种质信息时,如果每个人都有自己的一套描述方法,那将是多么混乱的局面!这份《树莓种质资源描述规范和数据标准》的出现,无疑是填补了这一重要空白。我期待它能像一份通用的“语言手册”,让大家能够用同一种方式来“说话”,准确无误地描述每一个宝贵的树莓种质。这不仅能极大地提高研究效率,减少信息误读,更能为全球树莓种质资源的有效管理和合理利用奠定坚实的基础,甚至可能催生出更加高效、创新的育种技术和栽培模式,为我们带来更多优质、健康的树莓产品。

评分

作为一名长期关注农业科技信息化的爱好者,我对《树莓种质资源描述规范和数据标准》这本书的期待值简直爆表。在信息爆炸的时代,数据孤岛和格式不统一的问题,在很多领域都阻碍了科技的进步。而对于像树莓这样具有重要经济价值和广泛种植潜力的作物来说,建立一套科学、严谨、可操作的种质资源描述规范和数据标准,其意义不言而喻。我设想,这本书的内容应该会涵盖从基础的形态学特征描述,到分子标记信息,再到抗病性、产量、品质等一系列关键性状的定义和记录方法。而且,更重要的是,它应该会提供一套标准化的数据模型和接口,方便不同数据库之间的数据交换与整合。这就像是为全球的树莓种质资源建立了一个统一的“基因身份证”和“能力报告”,让我们可以更轻松地进行比较分析,挖掘优良基因,加速育种进程。我非常好奇,书中是否会提供大量的实例,例如不同品种的树莓在各种标准下的具体描述,这样对于新手来说,学习和应用起来会更加直观和便捷。

评分

我是一位从事育种工作的技术人员,对于《树莓种质资源描述规范和数据标准》这本书,我有着职业上的强烈需求。在我们日常工作中,收集、整理和分析大量的种质材料信息是必不可少的环节。但长期以来,不同研究小组、不同项目之间的数据格式和描述标准参差不齐,导致数据复用率极低,信息整合的难度非常大。每次与其他单位进行合作,都需要花费大量的时间去进行数据转换和校对,效率低下且容易出错。所以,一本系统性地阐述树莓种质资源描述规范和数据标准的书籍,对我来说简直是雪中送炭。我非常期待书中能详细介绍各类重要性状的量化指标和测量方法,例如果实大小、颜色、风味、硬度等,以及如何科学地记录抗病虫害能力、产量表现、适应性等信息。同时,我也希望能看到关于如何构建数据库、设计数据录入界面以及进行数据质量控制的指导。如果书中还能提供一些数据分析的案例,展示如何利用标准化数据进行品种比较、亲缘关系分析等,那就更加完美了。

评分

作为一名休闲农业领域的从业者,我对《树莓种质资源描述规范和数据标准》这本书充满了好奇。我们经常会接触到各种不同品种的树莓,它们在口感、颜色、上市时间、抗病能力等方面都有着巨大的差异。而对于我们来说,如何才能更好地理解和应用这些差异,从而为消费者提供更优质、更多样化的体验,就需要一套统一的、科学的描述方法。这本书听起来就像是为我们提供了一份“树莓百科全书”的“操作指南”,它应该会帮助我们更准确地识别和区分不同的树莓品种,了解它们的特性,从而在采摘园的设计、品种的选择、病虫害的管理以及市场推广等方面做出更明智的决策。我特别希望能在这本书中看到一些关于如何将复杂的种质资源信息转化为易于理解的消费者导向型描述的内容,例如如何用生动形象的语言来形容不同品种的口感和风味,以及哪些品种更适合鲜食、哪些更适合加工。

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