　　《分子生态学与数据分析基础》首先从理论上介绍了分子生态学基本研究内容和手段，并总结作者以往的研究工作，较全面地概括了分子生态学理论内涵；然后从实践角度介绍了分子生态学数据获得的方法与具体分析内容和步骤，特别是采用图解法一步一步对分子生态学用到的各种主流分析软件进行过程讲解（包括作者编写的程序），不但有各类分析提示，还提供演示数据。《分子生态学与数据分析基础》具有极强的理论性和实践操作性，对于促进我国分子生态学发展，利用分子遗传标记手段进行物种经营、保护及资源利用和环境规划具有重要的推动作用。
　　《分子生态学与数据分析基础》可供高等学校、研究机构从事分子生态学和相关领域研究的师生，以及农、林、牧、副、渔、医各行业利用分子遗传标记开展研究的工作人员阅读参考。

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前言
第一部分分子生态学理论
第一章分子生态与遗传变异
第一节遗传变异的产生
第二节分子标记的种类
第三节遗传变异的衡量
第四节遗传变异的维持、丧失
第二章分子生态学研究内容
第一节个体与物种区分、鉴定（差异与多样性）
第二节基因流和适应
第三节小种群

第二部分分子生态数据获得与分析——以微卫星体分子标记为例
第三章分子遗传标记的获得——微卫星体
第一节微卫星体获得：MsatCommander、inGAP、MicrotFamily和GelQuest软件
第二节微卫星体数据初步整理分析：GenAlEx软件及其遗传多样性大小衡量
第四章遗传变异状况
第一节 Hardy-Weinberg平衡检测：Genepop、SGoF+软件
第二节连锁不平衡检测：Genepop软件
第三节等位基因丰富度比较：ADZE软件
第五章遗传分化
第一节 FST分析：Genetix软件
第二节 AMOVA分析：GenAIEx软件
第六章分组分析
第一节 Structure软件分析及CONVERT、Structure Harvester、CLUMPP软件
第二节 TESS软件分析及PAST、TESS Ad-Mixer软件
第七章空间遗传结构分析
第一节 sPCA分析
第二节 Alleles in space和Surfer软件
第三节空间自相关分析：SPAGeDi软件
第四节空间遗传结构的异向性：PASSAGE软件和R程序
第八章景观遗传学分析
第一节表面距离：ArcGIS软件
第二节加权线性距离、最小成本距离和阻抗距离：R程序
第三节 Mantel test和Partial Mantel test：PASSaGE软件
参考文献