基因调控机制 [Mechanisms of Gene Regulation]

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[芬兰] C.卡尔伯格,[芬兰] F.美恩 著,秦玉琪,钟耀华 译
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  • 基因调控
  • 分子生物学
  • 遗传学
  • 生物化学
  • 细胞生物学
  • 表观遗传学
  • 基因表达
  • 信号转导
  • 转录因子
  • 非编码RNA
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出版社: 化学工业出版社
ISBN:9787122246707
版次:1
商品编码:11820179
包装:平装
外文名称:Mechanisms of Gene Regulation
开本:16开
出版时间:2015-11-01
用纸:胶版纸
页数:206
字数:218000
正文语种:中文

具体描述

编辑推荐

适读人群 :生物学、医学基础等领域的研究生、高年级本科生和其他研究人员。
  《基因调控机制》内容以2001年以来一直由C. Carlberg教授在东芬兰大学教授的课程“基因表达的调控机制”为基础,分别从转录因子、染色质和非编码RNA的视角对基因调控作以概述。除了对生物学原理进行阐述以外,着重在新成果的总结方面。

内容简介

  无论在健康还是疾病研究领域,基因表达的调控几乎是所有生物学过程的基础。《基因调控机制》旨在将当前对基因表达调控机制的认知加以浓缩概述,不仅对经典的转录机器、转录调控、信号转导及染色质修饰等进行了精细深入的阐释,而且着重定位于描述后基因组时代的基因调控。《基因调控机制》体现了当前国际上基因表达调控研究的水平和动向,英文原著在国际学术界有较大影响,可供生物学、基础医学等学科的研究生学习和参考。

作者简介

  秦玉琪,山东大学国家糖工程技术研究中心,长期从事真核生物遗传学和功能基因组学的研究、特别侧重于真核生物转录调控的研究,对转录调控参与真核生物发育以及组蛋白修饰参与染色质重构具有深入研究。

目录

第一篇概述1
第1章介绍:什么是基因表达?3
1.1分子生物学的中心法则3
1.2基因转录的复杂性7
1.3转录调控元件8
1.4染色质活动在基因调控中的作用11
1.5基因表达程序12
1.6主要概念14
拓展阅读15
第2章染色质的功能16
2.1常染色质和异染色质16
2.2核小体19
2.3染色质开放和封闭时的组蛋白修饰22
2.4组蛋白修饰的基因组效应25
2.5染色质结构28
2.6表观遗传信号对健康和疾病的影响30
2.7主要概念32
拓展阅读33
第二篇转录因子篇35
第3章基础转录机器37
3.1核心启动子37
3.2TATA框42
3.3核心启动子元件44
3.4TFⅡD作为多蛋白复合物的范例46
3.5基因组范围内识别核心启动子的方法47
3.6中介复合物49
3.7主要概念52
拓展阅读53
第4章转录因子54
4.1位点特异性转录因子54
4.2转录因子结构域55
4.3二聚体化的转录因子复合物:核受体异源二聚体的例子59
4.4生物信息学方法识别转录因子结合位点61
4.5转录因子表达谱64
4.6转录因子的分类66
4.7主要概念68
拓展阅读70
第5章信号转导与基因调控71
5.1潜在转录因子的激活72
5.2转录因子网络74
5.3转录因子调控的程序性细胞分化76
5.4NFKB信号途径79
5.5炎症反应中的转录因子83
5.6感应细胞压力:p53途径85
5.7主要概念88
拓展阅读89
第6章基因表达开关:核受体的例子90
6.1核受体超家族90
6.2核受体的分子间相互作用93
6.3核受体的生理作用96
6.4核受体及其配体98
6.5核受体和辅因子的相互作用100
6.6主要概念102
拓展阅读103
第7章基因组作图104
7.1进化足迹法104
7.2ENCODE计划107
7.3ENCODE计划的数据挖掘109
7.4整合ChIP�瞫eq数据111
7.5转录因子的其他DNA结合模式113
7.6转录因子与靶基因的匹配115
7.7主要概念118
拓展阅读119
第三篇染色质篇121
第8章染色质修饰因子123
8.1组蛋白密码模型124
8.2组蛋白修饰酶128
8.3组蛋白标记的全基因组分析和它们的修饰酶132
8.4染色质修饰和疾病135
8.5主要概念137
拓展阅读139
第9章基因组印记140
9.1绝缘子140
9.2基因组调节器CTCF142
9.3基因组印记144
9.4绝缘子功能模型147
9.5CTCF介导的染色质结构的遗传148
9.6主要概念149
拓展阅读151
第10章表观基因组152
10.1DNA甲基化152
10.2基因组范围的DNA甲基化154
10.3DNA甲基化、异染色质和基因沉默156
10.4健康与疾病中的表观基因组学160
10.5主要概念163
拓展阅读164
第11章染色质重塑165
11.1染色质重塑的作用165
11.2ATP�惨览档闹厮芨春衔�167
11.3启动子上的核小体定位170
11.4先锋因子173
11.5转录动力学和噪声175
11.6主要概念177
拓展阅读178
第12章染色质结构180
12.1细胞核的组织180
12.2高级DNA环结构的形成182
12.3细胞核内的分区185
12.4转录工厂186
12.5核定位与疾病188
12.6主要概念188
拓展阅读189
第四篇非编码RNA篇191
第13章调控RNA193
13.1非编码RNAs193
13.2miRNA及其功能195
13.3长链非编码RNA199
13.4eRNA201
13.5miRNA和转录因子介导的基因调控203
13.6主要概念204
拓展阅读206

前言/序言


《生命密码的编织:遗传信息的涌现与控制》 在这部引人入胜的著作中,我们深入探索生命最根本的奥秘——基因如何被精确地读取、传递和调控,最终塑造出千姿百态的生命形态。本书并非对“基因调控机制”这一概念的简单罗列,而是以更广阔的视角,聚焦于遗传信息的动态涌现和生命系统如何实现对这些信息流的精妙控制,揭示生命之所以为生命的核心驱动力。 我们首先将目光投向遗传信息的起源与表达。从DNA的结构到染色体的组织,本书追溯了遗传信息的物理载体。在这里,我们将看到,DNA不仅仅是信息的静态存储库,更是一个活性的分子实体,其三维构象的变化能够直接影响信息的读取效率。本书将详细阐述转录的精妙过程,这并非一个机械的复制,而是涉及无数蛋白质复合物与DNA序列的复杂互动,它们协同作用,决定了哪些基因在何时、何地、以何种强度被“打开”。我们将深入分析启动子、增强子、沉默子等关键的DNA调控元件,以及与之结合的转录因子,它们如同精密开关,精确控制着基因的“点亮”与“熄灭”。 继而,本书将篇章聚焦于转录后调控的精巧设计。当mRNA分子被转录出来后,它们的命运并非一成不变。本书将详细描绘mRNA的加工过程,包括剪接、加帽和多聚腺苷酸化,这些步骤不仅影响mRNA的稳定性,更重要的是,它们为后续的调控提供了平台。特别是可变剪接,它赋予了一个基因输出多种蛋白质的可能性,极大地增加了蛋白质组的多样性,是生命复杂性的重要来源。我们将探讨microRNA、siRNA等小非编码RNA在转录后水平上如何精准识别目标mRNA,通过降解或抑制翻译来调控基因表达,它们是细胞内信息的“微调师”。此外,mRNA的定位、储存以及降解途径,都构成了基因信息流的另一层关键调控网络。 本书的另一重要主题是表观遗传学的革命性视角。我们认识到,基因的序列本身并非故事的全部。表观遗传修饰,如DNA甲基化和组蛋白修饰,能够改变染色质的三维结构,从而影响基因的可及性和转录活性,而这些修饰可以在不改变DNA序列的前提下被继承,甚至受到环境因素的影响。本书将深入探讨这些修饰如何被写入、识别和擦除,它们在细胞分化、发育、衰老乃至疾病发生过程中扮演着不可或缺的角色。例如,我们将详细解析组蛋白的“化学密码”,即乙酰化、甲基化、磷酸化等多种修饰如何协同作用,招募不同的蛋白质复合物,从而动态地重塑染色质的开放或紧密状态,实现对基因表达的精细调控。 更进一步,本书将视野扩展到非编码RNA的多元角色。除了microRNA和siRNA,大量的长非编码RNA (lncRNA) 也被发现参与到基因调控的各个层面。它们可以作为支架招募蛋白质复合物,可以作为诱饵屏蔽转录因子,也可以作为模板指导染色质的重塑。本书将揭示这些“沉默的巨人”如何通过多样化的机制,在染色质结构、转录起始、mRNA稳定性等多个环节发挥至关重要的调控作用,它们是生命信息调控网络中不可忽视的重要组成部分。 此外,本书还将审视发育过程中的基因调控网络。从一个受精卵分化成高度特异性的细胞类型,这是一个信息梯度和信号转导的复杂过程。我们将探讨发育过程中基因表达的顺序性、区域性和瞬时性,以及各种信号通路如何协调作用,激活或沉默特定的基因集合,精确指导细胞的命运决定和形态发生。形态发生素、同源异形框基因等关键调控因子在这一过程中的作用将被详细剖析。 本书还不会回避环境信号与基因调控的互动。生命并非孤立存在,细胞时刻接收着来自内外部环境的信号。本书将探讨这些信号如何通过各种信号转导通路,最终影响转录因子、非编码RNA的活性,从而改变基因的表达模式。这使得生命体能够适应环境变化,例如应激反应、营养感知以及昼夜节律等,都与基因表达的动态调控密切相关。 最后,本书将简要触及基因调控异常与疾病。许多疾病,从癌症到神经退行性疾病,都与基因表达的失调有着密切联系。通过理解基因调控的正常机制,我们能更好地认识疾病的发生机制,并为疾病的诊断和治疗提供新的思路。 《生命密码的编织:遗传信息的涌现与控制》将带领读者穿越分子生物学的迷宫,感受生命信息的勃勃生机与精妙绝伦。本书旨在提供一个全面而深入的理解,即基因调控并非简单的开关操作,而是一个复杂、动态、多层次的协同网络,它塑造了生命的形态,驱动着生命的发展,并最终成就了生命的奇迹。本书的语言将力求通俗易懂,但又不失科学的严谨性,适合对生命科学充满好奇的读者,以及希望深入理解生命本质的专业人士。

用户评价

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这本书给我的惊喜程度,简直是超乎了我的想象。一开始,我只是抱着“大概了解一下”的心态翻开的,毕竟“基因调控”这个词听起来就有点枯燥和晦涩。但当我真正沉浸其中时,我发现自己完全被吸引住了。作者并非简单地罗列科学名词,而是用一种非常生动、甚至可以说有些文学性的笔触,描绘了一个个精密的生物机器如何协同工作,让生命得以延续和发展。我特别喜欢其中关于“表观遗传修饰”的那几章,作者用了很多形象的比喻,比如把DNA比作一本厚重的史书,而表观遗传修饰就是给史书上的文字加注、划重点,甚至在某些章节上打上“禁止翻阅”的印记,而这一切都不改变史书本身的内容,却极大地影响了内容的解读和应用。这种解释方式,让原本复杂的概念瞬间变得触手可及。而且,书中不仅仅停留在基础的机制讲解,还巧妙地融入了大量最新的研究进展,让我深刻体会到生命科学的日新月异,也对未来的研究方向充满了好奇和期待。它不是一本死板的教科书,更像是一位循循善诱的导师,引导我一步步探索生命的奥秘。

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这次阅读经历,简直是一场知识的盛宴,让我沉醉其中,久久不能忘怀。作者的叙述方式极具感染力,他能够将极其专业的科学内容,转化为普通读者也能理解和欣赏的语言。我尤其被书中关于“信号转导通路”的讲解所吸引。作者将这些复杂的信号网络描绘成了一场精心策划的“细胞内部舞会”,各种分子扮演着不同的舞者,按照既定的舞步,将外界的信号传递下去,最终引起细胞的响应。他不仅详细介绍了关键的“舞者”和“舞步”,还解释了不同“舞会”之间的联系和协同,构成了一个庞大的生命活动网络。让我印象深刻的是,书中还探讨了不同细胞类型在基因调控上的差异性,以及这种差异性是如何赋予细胞多样功能和特异性的。这让我认识到,基因调控并非一成不变,而是高度动态和情境化的。这本书的阅读过程,就像是在探索一个未知的世界,每翻开一页,都能发现新的惊喜和奥秘,让我对生命的复杂性和精妙性有了全新的认识。

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这本书给我带来的震撼,不亚于我第一次看到宇宙星辰大海的浩瀚。我一直以为基因调控就是一些简单的开关,控制着蛋白质的合成。但这本书彻底颠覆了我的认知。作者以一种近乎诗意的语言,展现了基因调控的网络是如何如同一张巨大的、动态的社交网络,在细胞内不断地沟通、协作,从而实现生命活动的精确控制。特别是关于“转录因子”的介绍,作者将它们比作网络中的“社交达人”,它们需要找到正确的“约会对象”(DNA上的特定序列),并与其他“社交达人”协同才能完成工作。这种生动的比喻,让抽象的概念变得异常鲜活。书中还探讨了环境因素如何影响基因调控,比如营养、压力甚至情感,都能在分子层面留下印记。这让我深刻理解到,我们不仅仅是被动地继承基因,更是在与环境的互动中,不断地塑造着基因的表达模式。这本书让我对“生命”有了更深层次的敬畏,也激发了我对自身生命奥秘的探索欲望。

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这本书给我带来的体验,绝非仅仅是知识的获取,更是一种思维方式的重塑。作者的写作风格非常独特,他擅长在看似平淡的科学事实中挖掘出引人入胜的故事。我对书中关于“染色质重塑”的部分尤为着迷。作者将细胞核内的DNA比作一个极其拥挤的图书馆,而染色质重塑的过程,就像是图书管理员在不断地整理书架、移动书籍,以便让读者(转录机器)能够找到并阅读他们需要的“书籍”(基因)。他用了大量篇幅来阐述不同的重塑机制,以及它们如何协同作用,让细胞在不同的发育阶段和环境下,都能精准地调控基因的开启和关闭。这种细致入微的描述,让我看到了生命体系的精巧和复杂。书中还涉及到一些关于“基因组稳定性”的讨论,让我对遗传信息的准确传递有了更深刻的理解。总而言之,这本书不仅仅是关于基因调控的,它更是一种关于生命运作逻辑的深刻解读,充满了智慧和启发。

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读完这本书,我最大的感受就是,原来基因调控的世界如此迷人且充满艺术感。作者在讲述复杂的分子生物学过程时,展现出了一种令人惊叹的叙事能力,仿佛在绘制一幅幅精美绝伦的生命画卷。他不仅仅是在陈述事实,更是在挖掘这些事实背后的逻辑和意义。我尤其对书中关于“非编码RNA”的论述印象深刻。以前总觉得只有编码蛋白质的基因才重要,但这本书让我看到了那些“沉默的士兵”——非编码RNA,它们如何在幕后默默地影响着基因的表达,发挥着至关重要的调控作用。作者对这一部分的讲解,既有深度又不失趣味,让我对基因调控的理解上升到了一个新的维度。书中穿插的许多案例研究,更是让理论知识变得生动具体,例如某个疾病的发生与特定的基因调控异常有关,这让我看到了基因调控研究的临床价值和潜在的应用前景。整本书的编排也十分巧妙,从宏观的概述到微观的细节,层层递进,逻辑清晰,让我在阅读过程中始终保持着高度的专注和兴趣。

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书的内容不错,但是字好大,感觉对不起这个价格

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包装完好,开始学习

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基因调控机制基因调控机制

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